臺南市鼓勵學校針對健康問題進行評估及介入方案，以數據量化呈現學生健康行為的改變，辦理多元化健康活動，致力營造健康安全支持性環境及增進學生健康素養，獲得教育部國教署肯定，頒發109學年度推動健康促進學校計畫特優縣市。

市府教育局表示，台南市積極推動健康促進學校計畫，透過政策規劃、校群策略聯盟示範、健康教學活動、社區資源等，全力推動各項健康議題，將視力保健、口腔保健、健康體位、菸檳防制、全民健保及性教育等6大議題融入學校課程，透過課程教學與特色活動，以解決學生健康問題為核心，學生在「裸視視力不良率、視力不良就醫率、未治療齲齒率、齲齒複檢率」等數據都優於全國平均數據。

教育局指出，配合超額比序調整體適能成績占比，訂定「臺南市各級學校健康體適能與飲食教育行動計畫」，鼓勵學生養成規律運動習慣，增進體適能，並培養學生正確飲食習慣，計畫推動2年以來，已經展現初步成效，學生體位適中率有提升趨勢、肥胖率也逐步下降。新學年度研擬更多元活潑方式，如木偶劇、營養教育巡迴列車、健康知識小學堂等，讓學生寓教於樂，從生活中改變行為，深化個人健康促進觀念。