因為新冠肺炎及兩岸三地局勢發展影響，部分臺南市在台港澳生生活面臨困境，陸續向市府求助。市府教育局表示，對於港澳生的就學及生活照顧問題，市長黃偉哲已經責成教育局及社會局盤點相關資源全力提供關懷及協助。目前在臺南市的港澳學生共有580人，其中大專院校學生有571人，高中2人，國中小7人。市府將透過提供政府、學校與民間資源的連結協助，希望讓每位港澳生，都能在自由民主的臺灣安心生活、求學與安居。

教育局長鄭新輝指出，對於具有在臺合法居留身分的港澳居民，可以依學生就學年齡申請就學，國中、小學階段向教育局申請；高中職及專科以上學校，則向教育部申請，其中，申請就讀公立高級中等學校普通科者，依規定以國立華僑高級中等學校為限。申請就讀私校者，只要取得預計就讀學校的同意函就可以。