隨著南科聯絡道與新港社大道路口轉向高架道路工程推進，南科聯絡道將在6月21號起進行高架橋梁基礎工程施工，工程為期16個月，台南市政府交通局表示，期間雖然仍維持雙向通行，但需要縮減車道，為了降低施工期間的交通衝擊，除了要求施工單位施工前需要完備工區安全與導引設施，重要道路也設置改道導引牌面外，施工中也將機動調整路口紅綠燈秒數，並呼籲用路人提早改道替代道路，減少被堵塞的交通風險。

交通局指出，為了減少上下國道車輛與平面道路車流間干擾，因應南科就業人口成長的交通需求，透過「新港社大道與南科聯絡道路口轉向改善工程」，將道路採取立體化車道設計，未來國道8號新市交流道可以藉由高架道路直接進出南科，不必下平面道路等紅綠燈，將可以有效解決周邊交通壅塞問題，這項工程目前正由營建署積極趕工中，施工期間對道路交通衝擊影響在所難免，籲請所有用路人共同理解與配合。