農委會從去年1月1號起實施瀕危物種與重要棲地生態服務給付推動方案，瀕危物種有石虎、水獺、草鴞及水雉4種，臺南市有草鴞及水雉2種；另外重要棲地臺南市有水稻田、陸上漁塭及私有保安林等3類；市府農業局表示，去年在市長黃偉哲推廣及農民一起參與下，申請農地友善部分共計22多公頃；自主通報水雉雛鳥繁殖共計有1千6百多顆蛋，1千2百多隻孵化成功，孵化率百分之75.33；另外棲地維護-陸上魚塭也有47人申請，面積約159公頃。

市長黃偉哲指出，台南市要兼顧農民生產與生態保育，透過給付引導更多的社區及生產者的參與，維護農田豐富的生物多樣性，讓農地的生態服務價值能永續共享。為了復育水雉，市府從87年起辦理繁殖巢位通報獎勵，並提供農民趕鳥球及稻穀覆鐵粉等友善野生動物的耕作方式，經過多年努力，水雉數量由87年不到50隻，到110年冬季已經達到2252隻。另外草鴞屬於夜行性猛禽，為了避免因為不當驅鳥設施誤傷草鴞，市府將持續輔導西瓜田及鳳梨田，以友善方式設置驅鳥設施並推廣設立棲架，以提供草鴞停留監測。